2021年度特別展 文化財発掘Ⅷ「埋もれた古道を探る」
2021年度企画展 「増田友也の建築世界──アーカイブズにみる思索の軌跡」
2021年度企画展「医師になる！-京都大学の医学教育-」
2020年度特別展 文化財発掘Ⅶ 「木を遺す、木を伝える―木製品の調査と保存―」
2020年度特別展 梅棹忠夫生誕100年記念「知的生産のフロンティア」
2020年度特別展・京都大学iPS細胞研究所（CiRA）設立10周年記念展示「iPS細胞、軌跡（キセキ）と未来（ミライ）」
2019年度特別展 文化財発掘Ⅵー幕末・近代の出土文字資料ー
2019年度企画展 地の宝Ⅱ 比企鉱物標本
ICOM京都大会関連特別展「洛中洛外図屏風を愉しむ-絵画資料に親しむ方法の開発-」
2019年度企画展「タイムライン-時間に触れるためのいくつかの方法-」
