2020年度特別展 文化財発掘Ⅶ 「木を遺す、木を伝える―木製品の調査と保存―」
2020年度特別展 梅棹忠夫生誕100年記念「知的生産のフロンティア」
2020年度特別展・京都大学iPS細胞研究所（CiRA）設立10周年記念展示「iPS細胞、軌跡（キセキ）と未来（ミライ）」
2019年度特別展 文化財発掘Ⅵー幕末・近代の出土文字資料ー
2019年度企画展 地の宝Ⅱ 比企鉱物標本
ICOM京都大会関連特別展「洛中洛外図屏風を愉しむ-絵画資料に親しむ方法の開発-」
2019年度企画展「タイムライン-時間に触れるためのいくつかの方法-」
平成30年度特別展・文化財発掘Ⅴ 発掘 乾山窯
2018年度特別展 カメラが写した80年前の中国―京都大学人文科学研究所所蔵 華北交通写真
『思考の肖像』-美術と科学のダイアグラム-
